醫學人才培養依靠醫學教育的實施，而醫學教育的實施又依賴于學生在附屬醫院的實驗和實習。目前我國醫學院校的附屬醫院大多是水平較高的公立醫院，在已進行的公立醫院改革中，盡管醫學院校附屬醫院強化了疾病診療和預防功能，卻忽略了附屬醫院的教學科研等建設，這將嚴重影響醫療衛生人才培養的質量及醫療衛生事業的長遠發展。

目前我國醫學院校附屬醫院主要存在以下問題：因臨床帶教的直接經濟利益微不足道，附屬醫院存在教學意識淡薄、重醫輕教的問題；附屬醫院在醫院醫療、教學和科研三方面工作量遠超一般公立醫院，衛生技術人員處于超負荷工作狀態，但工資待遇不高；人才隊伍建設滯后，人員結構性失衡，學術交流有障礙；高考報考醫學的優秀人才減少，臨床實習生實踐機會減少、帶教問題多，醫學優秀后備人才匱乏；部分附屬醫院歸口管理不在醫學院校，導致定位不明、水平參差不齊。

醫改中應特別關注醫學院校附屬醫院的建設，建議將醫學院校附屬醫院作為公立醫院中的特殊一類，實行分類管理，明確其解決臨床疑難重癥、醫學人才培養及科學研究引領學科發展的功能定位。將現有高水平公立醫院按是否承擔高等醫學教育功能分類管理：一類是主要承擔臨床疾病診療和預防保健任務的醫療保健型（臨床型）醫院；一類是主要承擔醫學教育、醫學科研、疑難病癥診療任務的教學研究型（學院型）醫院。

其次，用科學評價和考核指標，指導附屬醫院的發展。根據附屬醫院的定位，設置解決臨床疑難病癥能力水平的臨床評價指標；設置醫學不同層次人才培養指標，包括醫學本科、碩士、博士、博士后、進修醫師等培養，住院醫師與專科醫師規范化培訓體系建設與培養質量等指標，臨床醫生專家團隊建設等人才隊伍建設。

同時應明確附屬醫院的歸口管理，明確人財物歸屬管理，每個附屬醫院應建立現代醫學教育中心，承擔本科、碩士、博士、博士后、住院醫師規范化培訓和專科醫師規范化培訓、繼續醫學教育功能；加大對附屬醫院的人力資源保障；提高附屬醫院醫務人員的待遇，建立醫務人員薪酬的制度化保障機制。

醫學院附屬醫院的管理也應加強。按學科帶頭人標準，培養選拔任用附屬醫院領導干部；明確教育科研任務，并納入績效考核，按醫教研防綜合功能加大附屬醫院人才培養力度，拓寬人才培養范圍，重視附屬醫院中青年醫療、科研、教學、管理等骨干后備人才的培養；鼓勵附屬醫院增設新的診療科目，探索和拓寬人才培養和科學研究的新領域。