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豬胚胎骨骼肌染色質(zhì)開放精細(xì)圖譜繪制成功
人民政協(xié)網(wǎng)18日電(記者 高志民) 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京畜牧獸醫(yī)研究所豬遺傳育種科技創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)成功繪制了豬胚胎發(fā)育全期骨骼肌基因組染色質(zhì)開放區(qū)域精細(xì)圖譜,鑒定出了調(diào)節(jié)肌肉發(fā)育的順式調(diào)控元件及相關(guān)基因,為進(jìn)一步研究豬胚胎骨骼肌發(fā)育相關(guān)基因的調(diào)控動力學(xué)奠定了基礎(chǔ)。相關(guān)研究成果發(fā)表在《畜牧與生物技術(shù)雜志(Journal of Animal Science and Biotechnology)》上。
據(jù)團(tuán)隊(duì)執(zhí)行首席張龍超介紹,豬胚胎肌肉發(fā)育主要集中在兩個生長波,即胚胎期35-60天,初級纖維形成;胚胎期54-90天,次級纖維生成。發(fā)育過程中,大量轉(zhuǎn)錄因子通過與開放的靶基因DNA序列結(jié)合來調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄的發(fā)生,進(jìn)而控制骨骼肌發(fā)育進(jìn)程。但由于豬胚胎期骨骼肌基因組范圍染色質(zhì)開放性尚不清晰,豬經(jīng)濟(jì)性狀分子機(jī)理解析及基因組育種技術(shù)創(chuàng)新受到制約。為攻克這一瓶頸問題,研究人員以大白豬為研究對象,利用ATAC-seq、RNA-seq等多種組學(xué)研究技術(shù),獲得了包含45、70和100胚齡時期骨骼肌表觀遺傳調(diào)控?cái)?shù)據(jù),并在三個胚胎時期分別鑒定出21638、35447和60181個染色體開放區(qū)域。
研究還發(fā)現(xiàn)多個調(diào)控肌肉發(fā)育相關(guān)基因的轉(zhuǎn)錄因子以及大量轉(zhuǎn)錄阻遏物,為豬功能基因組及性狀調(diào)控機(jī)制研究提供了重要參考。該研究得到中國農(nóng)科院科技創(chuàng)新工程、國家生豬產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系等項(xiàng)目資助。
編輯:魯雅靜
關(guān)鍵詞:胚胎 骨骼肌 染色質(zhì) 發(fā)育 開放