據報道，池中有乏燃料和未使用燃料棒共計392根。池上方堆積著因事故發生時的氫氣爆炸而損壞的屋頂框架等，要設置燃料處理機就必須移除這些瓦礫。由于移除作業中需要防止鋼架等落入池水中損傷燃料，東電計劃事先在池內水面覆蓋特殊保護罩。

東電通過遠程操控懸掛攝像機的吊車，對池內進行了拍攝，發現池內不存在妨礙設置保護罩的瓦礫，燃料上方也沒有大塊瓦礫。8月2日，東電曾確認了池水的渾濁程度，9月27日進行了詳細調查。

由于乏燃料池位于反應堆廠房最頂層，東電將把燃料移至核電站內的共用池中，進行更加穩定的保管。關于從發生堆芯熔化的3個機組取出池中燃料的工作，4月已在3號機組啟動，但問題不斷。由于瓦礫較多的1號機組和輻射量較高的2號機組，在準備上耗時頗長，東電將力爭2023年度開始取出。